眼眶核磁共振检查是检查眼部最好的检查方法之一，轴位观察玻璃体、晶状体、视网膜、眼肌、视神经，以及眼肌周围脂肪组织。

冠状位可以从前到后观察，并且核磁共振有压脂序列，可以清晰显示更多疾病。眼科可以测眼压，可以看屈光度，帮助近视、远视、散光等配眼镜，还可以看眼底，但是没办法看清内部结构，通过CT主要看眼眶的骨质以及周围组织间隙。

核磁共振检查看眼球内部以及周围组织情况，并能大概分清组织性质、囊性、实性，有没有脂肪、有没有出血等等，最典型疾病，如视网膜母细胞瘤、Graves眼病、视神经肿瘤等等。