阴茎上长菜花疙瘩，不能盲目治疗，首先需要明确具体所属疾病。例如常见的尖锐湿疣人群，就会在阴茎皮肤表面存在菜花状的疙瘩。这种情况下可以用激光切除，同时运用增强人体抵抗力的药物给予治疗，但是治疗前需要到医院做相关检查确诊。

另外，阴茎皮肤炎症或者湿疹，会导致阴茎皮肤增生，这时也容易引起阴茎出现菜花状疙瘩。此时需要涂抹复方醋酸地塞米松软膏，或者红霉素软膏抗炎治疗。

治疗恢复期间，要保持阴茎皮肤清洁干爽，这样对疾病康复有所帮助。