乙肝E抗原判断阴性还是阳性主要是根据乙肝两对半化验指标，目前乙肝两对半的检测分定性和定量两种。

如果是定性检测，根据检查结果标注乙肝E抗原阳性就判断为阳性。如果是乙肝两对半的定量检测，则不同的试剂盒有不同的参考范围，如果乙肝E抗原检测出的数值大于该试剂盒参考范围的上限，就表示乙肝E抗原阳性。乙肝E抗原滴度越高，说明乙肝病毒越活跃，复制能力越强。

对于乙肝E抗原阳性的患者，建议进一步检查乙肝病毒载量和肝功能，如果符合抗病毒治疗指征的建议抗病毒治疗。