霉菌性阴道炎不会在月经过后自愈。

虽然患有霉菌性阴道炎的女性，在月经期间会感到症状有所缓解，但这并不是病情快要痊愈的表现。而是由于月经期间引起阴道pH值发生变化，不利于霉菌的生长、繁殖，所以会有症状减轻。但是，霉菌并没有完全消除，等到月经期过了以后，仍会出现霉菌性阴道炎的临床症状，甚至还会加重表现。

因此，患有霉菌性阴道炎的女性，一定要按照医生的嘱咐进行系统治疗。如果病情需要经期也可以采取口服用药的方式，能够加强治疗效果。同时注意个人卫生，促进病情早日痊愈。