做腹部核磁共振最好是进行空腹检查，因为经过一夜，肝脏产生的胆汁在胆囊内储存，使胆囊处于膨胀状态，这样如果有胆囊内壁疾病，便于用磁共振进行观察、检测。若在检查前吃了东西，在脂肪类物质的刺激下，胆汁就会从胆囊排放出来，使胆囊呈空虚状，不利于部分胆囊疾病的观察。

另外肠道的内容物增多，还影响胆总管下段和胰腺的观察，食物或食物残渣产生的气体会影响胃肠道磁共振成像的正常成像。

做磁共振检查时，部分人会因为检查舱狭小以及机器发出的刺耳的噪音而产生不适感，可能会引发呕吐，所以不建议在做此检查前进食。