吞咽的时候喉咙疼牵涉到舌咽神经，舌咽神经痛多是放电样、针刺样，有时候会放射到外耳道深部，出现耳朵疼。

舌咽神经是颅神经的一对，支配的区域有扁桃体、软腭、舌根、咽喉部等，咽喉有炎症时，就会刺激舌咽神经，出现神经痛。

咽部神经主要有舌咽神经、迷走神经和交感神经干的颈上神经节构成的咽丛。

咽的生理功能就有调节中耳气压功能，咽鼓管的开放与咽肌的运功也就是吞咽运动关系密切，有时候咽喉急性炎症，继发咽鼓管功能异常，也会继发分泌性中耳炎，有时候也伴有耳痛，咽喉剧烈疼痛见于急性炎症，咽间隙感染或者喉咽癌晚期，疼痛都可放射至耳部。