孕妇的肾囊肿的处理方法包括：

1.对于原有肾囊肿的孕妇，在妊娠后一般情况下不会影响妊娠的过程。因为肾囊肿是常见的良性病变，发生率比较高，在4cm以下不会引起明显的症状，不需要进行处理。

2.孕妇在怀孕后出现肾囊肿，对于小的囊肿不需要进行干预，正常妊娠即可。

3.对于孕妇发现的肾囊肿，需要进行体检或者妇检的时候，观察囊肿的大小。一旦囊肿明显增大，合并感染和出血时要进行治疗。