低血糖与功能性低血糖的区别是功能性低血糖属于低血糖的一种。

所谓功能性的低血糖往往指的是没有器质性的疾病，发生低血糖可能和摄入不足或者运动量过大，再或者是一些诱因的情况下诱发了低血糖的发作，而低血糖其实本身的病因是有很多的，例如有些遗传性的疾病可以引起低血糖，还有胰岛素分泌过多，例如像胰岛细胞瘤可以引起低血糖。

再或者某些升糖激素分泌异常的疾病也可以引起低血糖，像腺垂体功能减退或者是肾上腺皮质功能不全、生长激素缺乏性的侏儒病等，这些疾病都是有明确的器质性疾病所引起的低血糖，和功能性低血糖是相对的概念。