肛门流黄色的脓有可能是肛周脓肿、肛瘘引起的，需要进行手术和抗感染治疗。

肛门流黄色的脓有可能是肛周脓肿自行破溃后形成的，一旦确诊后需要尽早做手术，将破溃的脓腔扩大，促进里面的脓液引流出来，再用双氧水清洗干净脓腔，伤口用纱条填塞引流，定期地消毒换药，结合应用消炎药物抗感染，促进伤口逐渐形成新鲜的肉芽，最后痊愈。

如果是肛瘘引起的肛门流脓，也要尽早做手术，将瘘口和瘘管完全切除，术后做好消毒换药，并静脉点滴抗感染的药物，才可以治愈肛瘘。