低血糖的主要危害主要表现在可能导致患者出现脑神经缺糖的症状，一般当轻度低血糖时，仅仅有交感神经兴奋性增强的症状，给予及时的诊断，正确的处理，大多数预后比较好。但是如果低血糖持续的时间比较长，可以导致不可逆性的脑损害，甚至死亡。

如果在新生儿低血糖，没有及时发现和处理，可以造成广泛的脑损害，导致智力发育不全等后遗症。还有一些反复发作低血糖，可能会使病人发生低血糖反应的血糖阈值下降，低血糖的临床表现就会变得越来越不典型。

而糖尿病病人，可能会因为低血糖的反复发作，而出现所谓的无知觉性的低血糖症。再有严重的低血糖，还可以发生低血糖脑病，甚至遗留肢体瘫痪。老年人容易诱发心绞痛脑血管痉挛，甚至心梗、脑梗等。