阴茎有腥臭味可能来源于包皮、冠状沟，也可能来源于会阴部的阴囊。还可能来源于阴茎、阴囊部位的毛囊炎症。要到医院泌尿外科就诊，可以检查清楚。

阴囊会阴部有大量汗腺，平时没有注意个人卫生，没有及时更换内裤或者内裤不干燥，阴囊每天分泌大量汗液，这个部位就会有潮湿，细菌滋生后就会产生腥臭味。

有包皮过长或者包茎，没有及时将包皮翻开清洗干净，包皮垢聚集增加，合并细菌、霉菌感染后发生包皮龟头炎，就会有腥臭味。

在阴囊或者阴茎的根部有毛囊炎，局部感染溃破后没有及时治疗，也会出现腥臭味。