导致单纯甲状腺肿大的原因有很多，常见的有缺碘、致甲状腺肿物质，或者是相关酶缺陷等非炎症、非肿瘤原因。

可以使甲状腺激素生成障碍，或者是身体对甲状腺激素的需求增加，而甲状腺激素处于相对不足状态时，垂体前叶就会分泌更多促甲状腺素，促进甲状腺增生肥大，呈现弥漫性或者是结节性肿大。这时甲状腺功能往往都是正常的，这种情况叫做单纯甲状腺肿大。

如果病例是处于地方性甲状腺肿流行区，也可以呈散发性的甲状腺肿大表现。