肥胖是由于内分泌疾病所导致的肥胖，又称之为继发性肥胖，包括库欣综合征、多囊卵巢综合征、原发性甲减、下丘脑性肥胖等。针对于此部分的患者产生肥胖，首先的治疗要治疗原发病，原发病的病因解除，肥胖也会自然好转。

除此之外，要进行一些控制饮食的治疗，常量的营养素的摄入原则和比例是脂肪20%至30%，其中饱和脂肪酸占8%至10%、单不饱和脂肪酸占15%、多不饱和脂肪酸占10%、胆固醇摄入每天小于300毫克、蛋白质占15%至20%、碳水化合物占55%至65%。

可以选择低热卡饮食，供给热卡约为1200千卡每天，治疗12周可使体重减轻5公斤。如果配合运动和教育，则可使体重减轻的更多。