包茎手术是属于泌尿外科的常规的成熟小手术，手术之后出现小便疼痛有可能是由于手术刺激导致的龟头包皮充血水肿，包皮充血水肿会挤压尿道，排尿过程中引起的疼痛，另外也有可能是由于手术刺激导致的身体免疫能力下降，继发了尿道炎或者是膀胱炎所引起的炎症性反应引起小便的时候有疼痛的感觉。可以检查一下血常规、尿常规确诊是否有实质性的感染因素，如果有感染因素的话，可以配合碳酸氢钠片以及阿奇霉素分散片、维生素c进行抗炎治疗，如果排除炎症的话，多饮水，放松心情，注意生殖器的卫生就会逐渐恢复。