肾周脓肿大部分是由肾脓肿破溃后脓液进入肾周引起的，结石梗阻引起的肾盂积脓破溃进入肾周是最常见的，尤其是糖尿病患者抵抗力差，更容易发生肾周脓肿。

还有一小部分的肾周脓肿患者为全身性严重感染时血行播散形成，肾脓肿的形成主要是尿路梗阻造成的上行感染，但是双侧输尿管同时梗阻的情况是很少见的，所以肾脓肿一般是单侧发病，因大部分的肾周脓肿的形成都跟肾脓肿有直接的关系，所以肾周脓肿也是单侧发病为多见。