孕妇感染病原微生物后经过垂直传播感染胎儿，从而造成先天性畸形。

最常见的病原微生物有：

一、梅毒螺旋体。梅毒螺旋体可以通过胎盘进入胎儿血流，并且扩散到肝、脾、肾等内脏，并大量繁殖引起胎儿全身性感染。

二、风疹病毒。在孕期四个月内感染风疹病毒，可以经过胎盘垂直传播。

三、单纯疱疹病毒。妊娠妇女因单纯疱疹病毒原发感染或潜伏感染被激活，病毒可以经过胎盘感染，影响胚胎细胞的有丝分裂引起胎儿畸形或者智力低下。

四、巨细胞病毒。通过胎盘感染胎儿，引起造血系统、中枢神经系统的损伤，从而出现小脑畸形，视神经萎缩等情况。

五、人类免疫缺陷病毒及人乳头瘤病毒，都可以通过胎盘或者是产道导致胎儿或新生儿先天性感染。