血吸虫病早期诊断的主要依据是根据患者的临床表现、流行病地区生活居住史以及病原学检查、免疫学检查等。

病原学检查方法主要是从患者粪便内检查到血吸虫的虫卵或者有毛蚴，就可以对疾病进行明确的诊断；也有些患者是进行直肠黏膜活体组织检查有虫卵，比较常用的病原学检查方法主要包括塑料杯顶管孵化法、尼龙袋集卵孵化法、改良加藤法等。

患者也可以使用酶点免疫吸附试验、间接红细胞凝集试验、斑点金免疫渗滤试验、胶体染料试验条法等免疫学诊断方法，进行血清中循环抗原、循环抗体以及免疫复合物的检查。