出现低烧、浑身疼痛的现象，主要是由于真菌、病毒或细菌等病原微生物侵入机体之后，会影响到下丘脑的体温调节中枢。此时会由于散热减少、产热增加，出现发烧症状。

在发烧期间会有前列腺素等内生性致热原被释放，从而导致浑身疼痛的现象。除此之外，发热期还会形成乳酸堆积，也会导致全身酸痛、身体乏力，退烧之后症状一般就会改善。

除此之外干燥综合征、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎，也都有可能会使机体出现低烧与浑身疼痛的现象。