吉尔伯特综合征产生的主要病因是由于肝细胞摄取胆红素，以及胆红素定向运输产生了障碍。

也有可能是肝细胞内葡萄糖醛酸转移酶活性出现了问题，所以会导致血中间接胆红素增加，继而产生一些与肝相关的疾病特征。

虽然初期在临床上没有明显特征，但是病人经常以慢性或复发性黄疸为特征，黄疸可稳定不变或明显波动，在经历情绪激动，疲劳、受凉、喝酒后或者并发感染等，都可能会导致黄疸加重，黄疸加重时可有乏力、消化不良或轻度肝区疼痛。