如果患者早晨起来脑壳疼主要和以下原因有关：

1.睡眠不足。患者由于长时间的熬夜、打游戏、工作，或其他的娱乐活动，导致睡眠不足，清晨起床的时候会有脑壳疼的症状。

2.鼻窦炎。本病发病的时候会出现流脓涕、头痛等不适的症状。需要到耳鼻喉科进行鼻腔冲洗和抗生素消炎治疗，必要的时候还需要做引流治疗。

3.高血压。当血压突然之间增高的时候，也有可能会引起脑壳疼痛的症状。通过测量血压明确诊断，使用降压药物调整血压，血压下降后脑壳疼的症状可逐渐缓解。