马尔尼菲青霉病可以引起全身各个系统的症状。如果这个病表现在皮肤，可以在皮肤上出现全身各部位的结节。在结节的基础上可以出现进一步的化脓现象或者是皮下脓肿，呈绿豆至硬币般大小。播散性的分布其数量通常非常多。

如果马尔尼菲青霉病发生于内脏器官，也有可能会导致肝脏、肺脏或者是骨髓以及扁桃体等部位的症状。

在肺部的时候患者能够表现出咳嗽、咯血、咯痰或者是呼吸困难。如果表现在心脏的时候，则可以出现心包炎或者是心包积液。