脑血栓常用的药物有副作用。患者发生脑血栓后，常用的药主要包括抗血小板聚集的药物，有阿司匹林和氯吡格雷。抗凝的药物有肝素、低分子肝素、华法林，溶栓的药物有阿替普酶和尿激酶。

用药后患者可能会出现全身皮肤出血点和瘀斑，可以出现牙龈出血，也可能会出现上消化道出血。用药过程中，应及时进行观察。患者一般常规应用他汀类药物，调脂稳定斑块，比如辛伐他汀、阿托伐他汀钙片。

部分患者用药后，可能会引起血转氨酶升高。用药过程中应定期监测肝功，有异常时应减量或者是停药。