自然流产以后一直有褐色的分泌物，最常见的原因就是不全流产，宫腔内可能还会有胎盘、胎膜的残留。也有可能是自然流产以后，造成了宫腔内的感染，出现子宫内膜炎，都会出现有褐色分泌物。所以，必须尽快地到医院去做一下B超检查和妇科检查。

如果宫腔内还有残留物，是必须尽快地做清宫治疗。因为宫腔里有残留物，最容易引起感染或者是大出血。

如果是宫腔干净了，有可能就是炎症引起的，需要应用消炎的药物和促进子宫收缩的药物，避免出现宫腔粘连和慢性盆腔炎，影响以后的怀孕。