新生儿眼睛肿，考虑以下几种原因：

1.体位性水肿。比如宝宝总是喜欢侧着睡觉，靠近床的部位就容易出现水肿，这种情况经过调整体位可以好转。

2.结膜炎。当结膜发生炎症容易导致水肿，观察眼睛是否有分泌物或者充血等情况。如果有问题，在医生的指导下使用眼药水，常用的是抗生素类的眼药水进行治疗。

3.一些疾病的原因。比如肝肾功能异常或者低蛋白血症，也会出现眼睛水肿的表现，需要观察是否有其他不适的症状，比如尿少、黄疸、呼吸困难、多汗等，必要的时候到医院进行检查治疗。