多发性胆管结石的治疗包括手术治疗和非手术治疗，具体的治疗方案需要结合患者的实际病情。无症状的结石可不予处理，只需定期的观察。如果出现症状，要以排石、疏肝、利胆为基本治疗方法，缓解症状，缩短病程，减少复发，避免并发症的出现。保守治疗包括抗感染、解痉、镇痛、利胆和支持对症处理。出现休克者应加强抗休克治疗，如吸氧、维持血容量、及时使用升压药物等。

临床上目前对于多发性的胆管结石，主要是以手术治疗为主，具体的方案需结合实际病情。