集聚肠杆菌感染的病原菌为革兰氏阴性杆菌、鞭毛周菌，属肠杆菌科，在表型和基因型上都是一个异源群体。在正常人的肠道和上呼吸道偶有发现。

免疫功能低下的患者，如早产儿和新生儿、烧伤、多发性创伤、肿瘤患者、免疫抑制剂患者、大剂量激素患者等，也可能因各种插管、手术和输入受污染液体而发生机会性感染。

感染时，对于输液引起的败血症，应先排除感染，再尽早使用有效的抗生素。由于不同菌株对不同抗生素的敏感性差异较大，应根据药敏试验结果选择首选抗生素。