早上起来眼睛充血，可能是由于睡眠不足导致结膜受到刺激导致的，可能是由于轻度结膜炎导致的。

眼睛表面被结膜所覆盖，结膜是富含血管成分的膜组织，能够为角膜等器官提供氧气等营养成分。患者如果夜间睡眠质量不佳，导致眼部的血液循环不畅，引起结膜受到刺激可能会产生轻度的充血。患者在睡前没有做好清洁，眼睛接触到病原体，病原体经一夜的繁殖造成结膜的炎症，引起结膜充血。

患者可以到医院进行检查，如果确定是由结膜炎导致充血，应该及时使用一些抗生素类的药物进行治疗，防止炎症面积的扩大，造成患者视力的损伤。