先天性输尿管瓣膜炎对人体的危害很大，先天性输尿管瓣膜炎的发病基础是先天性输尿管瓣膜。

由于输尿管畸形的存在，会导致尿液进入膀胱阻力增大，导致膀胱以上的输尿管出现扩张，出现尿液的淤积。尿液引流不畅就会导致输尿管瓣膜发生炎症，患者可以出现发热、尿急、尿频、尿痛的症状，还可以出现输尿管的绞痛。

如果输尿管瓣膜反复发炎，就会导致输尿管解剖上的狭窄程度加重，患者可以发生肾积水，甚至肾功能损伤。