在临床上小肠癌晚期的病人，常合并不同程度的腹痛，可以是上腹部隐痛或者烧灼样痛，也可以是钝痛感觉，类似十二指肠溃疡的疼痛。这种疼痛在进食和使用抑酸药之后，不能够获得有效缓解。

如果癌肿侵及到胰腺或者后腹膜的时候，疼痛可以向腰背部进行放散。一部分小肠癌的病人可以发生黄疸现象，并且可以进行性加重。病人可以伴有皮肤瘙痒、大便呈陶土样、尿色呈浓茶样。

随着病变发展，有的病人可以出现小肠梗阻的现象，病人可以出现上腹部饱胀、恶心、呕吐等情况。由于长期进食减少，晚期小肠癌病人还可以出现周身无力、食欲减退、体重减轻、贫血、发热等全身症状。