患者腿上长囊肿并且伴有疼痛，如何进行治疗，需要根据其囊肿的情况等进行判断。

如果腿上长的囊肿体积比较大，就会导致局部的皮肤出现压迫的现象，从而就会引起疼痛症状的出现。需要通过手术方法治疗才能去除，达到根治的目的。

如果腿部出现的囊肿，还出现了感染，就会出现局部的红肿、疼痛。可以先使用碘伏等对患部进行消毒处理，同时搭配口服一些抗生素，进行加强抗炎治疗。只有炎症得到控制，囊肿的情况才可以得到有效缓解。