精子畸形大多数患者无临床症状。

由于导致精子畸形的常见原因是不良环境以及不良生活嗜好，常见的是高温、辐射环境或者是长期大量饮酒、熬夜等，影响精子的正常形态而导致精子的畸形率增高。

精索静脉曲张、附属性腺体慢性感染性疾病导致的精子畸形，可有相应疾病的伴随症状，常见的是重度精索静脉曲张导致阴囊以及大腿等部位坠胀不适。临床慢性前列腺炎可伴随尿道口滴白、尿不尽以及射精过快等相关症状。为了促使精子状态恢复，需要药物治疗前列腺炎、手术治疗精索静脉曲张。