肩手综合征的具体病因目前尚不十分地明确，但是引起患者出现肩手综合征的因素和病症非常地多，诸如肩关节疾病、截瘫、颈椎病等。

肩手综合征有时会原发性地出现，有时也会受到多种因素的影响而促发出现，患有脑血管病急性发作时血管运动中枢受到影响，患者患肢的交感神经会异常地兴奋。

另外，当患者心肌梗塞、内分泌紊乱、脊髓出现损伤、中枢神经系统、周围神经系统损伤等因素的影响，都可能会诱发出现肩手综合征。无论是哪一种诱发因素导致的，都会使患者的自律交感神经受到影响，造成末梢神经血管出现障碍。