复方黄连素适用于肠道感染导致的腹痛、腹泻症状。复方黄连素片为糖衣片，除去糖衣后显棕黄色至棕褐色;味苦、微辛。每片含盐酸小檗碱30mg、木香116mg、吴茱萸40mg、白芍162mg。盐酸小檗碱是该药的主要成分。

盐酸小檗碱又名黄连素，是一种重要的生物碱，可从黄连、黄柏、三颗针等植物中提取。具有显著的抑菌作用，能对抗病原微生物，对多种细菌如痢疾杆菌、肺炎球菌、伤寒杆菌及白喉杆菌等都有抑制作用，其中对痢疾杆菌作用最强，常用来治疗细菌性胃肠炎、痢疾等消化道疾病。