起床耳朵疼可能有以下原因：

1.睡觉的时候有耳廓挤压，挤压时间过长导致局部出现软骨，或者耳朵皮肤损伤，从而导致患者出现耳朵疼痛感。

2.睡觉的时候有飞虫等异物进入耳朵，在耳内爬行或者刺激耳道以及鼓膜，可以诱发耳朵出现疼痛感。

3.可能是睡觉的时候受凉感冒，或者睡觉的时候反复吸鼻涕，容易诱发出现急性分泌性中耳炎、急性鼓膜炎等相关疾病，大多数会出现耳朵疼痛感甚至伴有听力下降。是临床上耳朵疼比较多见的原因，尤其好发于抵抗力低下的儿童。

起床后耳朵疼需要到耳鼻喉科检查，看看到底是哪种原因导致的。