新型冠状病毒肺炎是由新型冠状病毒感染引起的。新型冠状病毒是一种全新的病毒，既往并未在人类中发现。本次的新型冠状病毒，不仅在感染的人体内被检测到，在海鲜市场非法销售野生动物的摊位上也分离了出来。这说明新型冠状病毒是来自于野生动物来源的。

研究人员认为蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主，其中水貂可能为中间宿主。蝙蝠身上有多种冠状病毒，这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物，再传染到人。但具体的传播方法，中间宿主还没有具体的明确。