龟头内侧小红疙瘩的治疗处理需要根据诱发病因决定。

致病菌感染导致血管过度扩张引起的炎性红色小疙瘩，可服用诺氟沙星药物抗炎治疗，局部用低浓度高锰酸钾液清洗，炎性疙瘩可逐渐被吸收消散。由于个体生理变异生长的小疙瘩，无任何伴随症状，并且长期存在，可不做任何治疗处理。

包皮过长或者由包茎导致的小红疙瘩反复发生，需要经常用温热水清洗龟头、包皮内板。也可考虑做包皮环切手术，术后促使龟头暴露，可有效预防包皮垢刺激，也可有效预防感染，避免红色小疙瘩反复发生。