雌二醇偏低大多说明女性体内的卵巢功能下降或者是下丘脑垂体的功能失调，以及高泌乳素血症引起。雌二醇主要是由卵巢和胎盘产生，少量的是由肾上腺产生。在临床上，当女性到了更年期以后，卵巢的功能就会下降，这样就会导致体内的雌二醇降低。

另外，如果一些药物，尤其是一些抗肿瘤的药物，对卵巢功能有影响，也会导致女性体内的雌二醇降低。还有的女性如果体内的泌乳素水平增高，这样就会抑制垂体激素的分泌，从而使卵巢分泌的雌激素下降。另外，下丘脑和垂体的功能失调也会导致雌二醇下降。