半夜惊醒之后心脏不舒服，需要根据症状的特点选择不同的检查。

第一，心脏部位疼痛。需要正规检查心电图以及超声心动图，看看有没有心脏疾病引起，比如心肌缺血或者心肌病一类的情况。必要的时候还需要结合冠状动脉造影检查，判断有没有冠状动脉狭窄的现象，引起夜间惊醒之后出现心脏部位疼痛。

第二，心慌、心悸症状发作。需要检查心电图以及24小时动态心电图，以判断有没有早搏以及房颤一类的心律失常引起心慌、心悸。

此外，如果检查排除心脏疾病引起，也可以考虑胃镜检查，以明确有没有胃食管反流引起症状发生可能。