阴茎里面总是隐隐的疼，可能为阴茎损伤、尿道炎、尿道结石等因素所引起。

如果在性生活时用力较大，可能会导致阴茎内部出现损伤，就会引起阴茎隐痛的症状。应当多休息，避免性生活，通常在3~5天后会自愈，一般没有不良影响。如果阴茎疼痛还伴有尿频、尿急，以及尿道口脓性分泌物增多等症状，可能是尿道炎所引起，在确诊后应使用抗生素类药物进行治疗，比如左氧氟沙星、阿莫西林等。

如果阴茎内的疼痛持续加重，还伴有明显的血尿，可能是尿道结石所引起。在确诊后，应进行相应的排石处理。