咽口水的时候有疼痛感，可能与下列因素有关：

1.咽喉部位有鱼刺或者是骨头等异物卡顿，导致在咽口水的时候，牵拉到了异物卡顿部位的肌肉和黏膜，造成了受损部位的刺激性疼痛感。

2.患有急慢性咽喉炎或急慢性扁桃体炎等疾病时，咽喉黏膜会出现充血、肿胀的表现，此时吞咽口水，会刺激咽喉黏膜出现疼痛感。

3.患有食道癌或者咽喉或扁桃体恶性肿瘤的患者，在吞咽口水的时候，也会由于触碰到了恶性肿瘤附近的肌肉，造成肌肉的牵拉，引发肿瘤部位的疼痛情况出现。