超声内镜的价格不能一概而论，根据不同的城市级别和不同的医院规模，它的价格是有所不同的。超声内镜与小肠镜、胶囊内镜均相同，大部分都没有纳入医保的范围，属于自费的项目。

一二线城市三级甲等医院的小探头超声内镜的费用大概在800元左右，再加上化验费、病理费，它的费用就是1000元左右。如果进行大探头的超声内镜，可以检查胰腺病变或者其它部位的病变。

并通过超声内镜的引导穿刺，费用就更高一些，大概在1500左右。所有这些费用都是自费，没有被纳入医保或者农合疗的范围。