婴儿患有结膜炎时，应结合具体症状、感染病菌类型等情况来综合分析。常规要选择刺激性小，副作用较少，安全性高，适合婴幼儿使用的眼药水治疗，同时可以使用物理治疗方案缓解症状。

如果确诊为细菌性感染，可以选择妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液点眼，眼药水开封后一个月内使用有效。

如果为病毒性感染，病情相对重，可以选择阿昔洛韦眼药治疗，分泌物增多时，用生理盐水清理眼睛。必要时给予重组人表皮生长因子眼用凝胶，保护角膜。