临床用于治疗射精后尿道痛伴有颗粒感的常用办法有病因治疗、抗感染治疗等。

1.病因治疗。男性在射精后出现尿道疼痛并伴有颗粒感，很可能是因为精液无法从尿道正常排出，反而逆行流入膀胱内导致的，好发于糖尿病、高血压患者，和长期服用某种影响射精功能药物的人群，这时要采取措施消除病因，积极治疗原发病。

2.抗感染治疗。患有精囊腺炎或尿道感染的男性，可能因为炎症刺激导致精液流通不畅或尿液浑浊，都可使尿道疼痛并伴有颗粒感。这时需要接受专业医生的抗感染治疗，如口服头孢拉定片、阿莫西林胶囊和盐酸左氧氟沙星片之类的抗生素。