乳腺癌患者复查时发现癌胚抗原增高，考虑临床上有以下几个方面的原因：

1.乳腺癌疾病出现复发或者转移等病情的变化，因此导致癌胚抗原这种肿瘤指标出现增高的情况，需要进一步完善检查评估病情。

2.乳腺癌的病变没有发展，但是患者出现其他的癌症病变，也会导致癌胚抗原指标的升高，也是需要检查明确疾病类型。

3.乳腺癌患者复查时存在严重胃炎、妇科感染，或者是患者处于妊娠的初期等情况，也可以出现癌胚抗原指标的轻度升高。需要通过检查明确具体的原因，不能遗漏乳腺癌疾病的进展，同时也不必过于恐慌。