男性生殖器做了增大手术有副作用，任何手术都有一定的风险，阴茎增大手术后也有一定风险，手术之后也有一定的副作用。

一、目前阴茎增大手术主要是在阴茎内部植入特殊的物质，植入的假体可能出现感染，也可能引起患者不适的临床症状。

二、手术后阴茎较前增大、增粗，但是可能会降低阴茎的敏感性，导致射精障碍。

三、手术之后切口可能存在出血、感染、裂开、不愈合、延迟愈合等情况。如果是瘢痕体质的患者，缝合处会留下瘢痕。如果瘢痕过大会影响性功能的可能，一般需要再次行手术切除。所以，在临床上不建议患者盲目的去做生殖器增大的手术。