儿童生殖系统畸形，首先需要先到医院就诊检查，明确诊断，确定什么原因造成的，是否是基因等情况影响，一般需要就诊泌尿科或者普外科。

最常见的原因考虑可能是由于感染或者是包皮过长，系带粘连等情况引起来的。如果是包皮过长造成的，可以通过包皮手术等方式处理，就能改善症状，同时需要定期的换药，防止发生感染等情况。

如果是其他原因造成的，根据病情的情况选择进一步的治疗，有的需要通过生殖器整形这种方式处理。保持良好的个人卫生，注意休息。