单侧肾动脉胆固醇结晶栓塞的患者，如果患者患有肾外系统的疾病，应积极的进行抗凝或在导管室内行栓子切除等非手术方式治疗。目前经皮穿刺，动脉内注入纤溶剂，比如链激酶，是治疗急性肾动脉栓塞的一种非常好的非手术治疗方式。

手术治疗过程中的肾血管再通术，通常适用于双侧或者是孤立肾的肾动脉血栓栓塞。假如患者存在晶皮血管造影及核素扫描，证实的足以维持肾活力的侧枝循环，可以通过非手术疗法去进行实验性治疗。