先天性尿道下裂根据尿道外口开口的部位不同，引起的症状不同，所需要的治疗方式也不同。对于尿道外口开口在龟头上的尿道下裂患者，如果没有引起明显的临床症状，此时是可以不用治疗的。

如果患者的尿道外口，开头在龟头冠状沟以下的阴茎，往往会出现排尿异常的情况。此时往往需要行手术治疗，手术的目的是矫正阴茎下弯和形尿道成形。

如果尿道外口的开口较为靠近龟头，此时可以行一期手术，将尿道外口开于龟头上。如果距离龟头较远或伴有明显的阴茎下弯等畸形，一般需要二期手术治疗。