会厌囊肿不会自己消失。会厌囊肿是人体咽喉部比较常见的一种良性肿物，主要是由于咽部的粘膜细胞腺毛囊口堵住后，引起咽部腺体分泌物无法正常排出所导致的症状，会导致吞咽功能的异常，使患者轻度呛咳，以及咽喉部有异物感。

当囊肿比较大的时候，患者还会出现呼吸困难的症状。如果患者有明显的症状，需要到医院做喉镜的检查，观察囊肿是否有增大。

如果会厌囊肿持续性的增大，需要住院进行囊肿摘除手术，术后需要用抗生素以及激素类的药物进行治疗，术后一周基本可以痊愈出院。