肛门脓肿术后一般是在3天到1周左右不疼，存在一定的个体差异性。

肛门脓肿属于开放性的手术，术后24小时之内会在肛门内填塞敷料，患者会有较为明显的坠痛感。在术后24小时将敷料取出以后，可以进行正常排便。

在排便的过程当中，由于粪便的摩擦刺激，而且开放性伤口神经末梢组织裸露，会导致疼痛发生。在术后3天左右，因为排便产生的疼痛会逐渐得到缓解。

另外，随着伤口恢复，肉芽组织增生，裸露的神经末梢组织逐渐被肉芽组织或者皮肤所覆盖，该过程在1周左右，所以在术后1周左右多数患者就不再有疼痛。